Existe um caminho. Eu esqueci exatamente como eu fiz isso antes, mas no Win 7, meu computador tinha uma pasta "Meus Aplicativos" para os aplicativos que baixei para o BlueStack em algum lugar (talvez MyDocuments? MyComputer? Favoritos? Não tenho certeza), e tudo que fiz foi dê um duplo clique no aplicativo para executar o aplicativo. Agora? Eu não tenho certeza. Tentando me descobrir no Win 8.
Edit: eu encontrei uma maneira
C:\ProgramData\BlueStacks\UserData\Library\My Apps
Este endereço contém os aplicativos que você deve abrir em sua área de trabalho e abrirá no BlueStacks.
links para os aplicativos
C:\ProgramData\BlueStacks\UserData\Library\My Apps[file name].lnk
por exemplo
C:\ProgramData\BlueStacks\UserData\Library\My Apps\FlappyBird.lnk