Não há nada que você possa fazer para conseguir isso. Geralmente, os aplicativos não devem ser lançados várias vezes. Alguns, como o Safari 5, o TextMate ou o iTunes, comportam-se de maneira estranha ou evitam isso completamente.
Mas você pode incluir essa chamada em linha de comando ou, de preferência, a melhor maneira suportada
open -n -a Mathematica
em um script do Automator. Dessa forma, você pode iniciar um programa ou executar um Serviço que inicie a segunda instância do Mathematica.
Para fazer isso, abra o Automator , selecione Aplicativo ou Serviço , clique duas vezes em Executar Script do Shell ação na Biblioteca à esquerda e adicione sua chamada de linha de comando a ela. Eu sugiro que você use o meu, porque ele retorna imediatamente após o lançamento do programa. Se for um serviço, selecione que ele receba nenhuma entrada em qualquer aplicativo .
Agora salve-o. Se for um aplicativo, armazene-o em qualquer lugar e arraste-o, por exemplo. para o Dock, a barra de ferramentas do Finder ou a barra lateral do Finder para acesso rápido; se for um serviço, está no submenu Serviços do menu do aplicativo. Você pode até atribuir um atalho de teclado em Preferências do Sistema »Teclado» Atalhos de Teclado »Serviços .