Bem, eu quero dizer que você pode entrar nas configurações do MSE e apenas excluir um diretório, isso é um bom compromisso? Eu suponho que não funcionaria se uma hacktool que você tenha, na verdade, estivesse infectada.
Até onde eu sei, você não pode conseguir excluir uma classe de ameaça, apenas um tipo de arquivo ou arquivo / local.