runas /user:domain\administrator commandtorun
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O pop-up é a tecnologia de controle de conta de usuário (UAC) do Windows, e você não pode ignorá-la porque aumenta a segurança exigindo a confirmação do usuário. Isso é semelhante ao sudo requerendo uma senha. Você pode desativar o UAC, assim como você pode ativar o sudo sem senha. É verdade que o UAC não é tão configurável quanto o sudo.