Coloque o arquivo em ~ / .local / share / vlc / lua / extensions. Eu chamo de DeleteFile.lua.
Quando você inicia o VLC, obtém um novo item de menu: Visualizar > Detetefile. É este último passo que eu estava faltando.
Edite 20170731
O código não funcionou muito bem. Eu mudei:
Agora ele procura por um diretório chamado .waste
no diretório do arquivo e qualquer diretório (grand *) dirs e move o arquivo para lá.