Existem algumas mudanças importantes no comportamento dessas duas invocações. Vamos usar um exemplo, com a estrutura criada por:
mkdir mydir/{.a1,a2,a3}/{.b1,b2}/{.c1,c2} -p
Se você invocar du --max-depth=2 mydir , verá:
0 mydir/.a1/.b1
0 mydir/.a1/b2
0 mydir/.a1
0 mydir/a2/.b1
0 mydir/a2/b2
0 mydir/a2
0 mydir/a3/.b1
0 mydir/a3/b2
0 mydir/a3
0 mydir/
Mas se você for:
du --max-depth=2 mydir/*'
o caractere curinga será expandido e se tornará equivalente a:
du --max-depth=2 mydir/a2 mydir/a3
que lhe dará o seguinte resultado:
0 mydir/a2/.b1/.c1
0 mydir/a2/.b1/c2
0 mydir/a2/.b1
0 mydir/a2/b2/.c1
0 mydir/a2/b2/c2
0 mydir/a2/b2
0 mydir/a2
0 mydir/a3/.b1/.c1
0 mydir/a3/.b1/c2
0 mydir/a3/.b1
0 mydir/a3/b2/.c1
0 mydir/a3/b2/c2
0 mydir/a3/b2
0 mydir/a3
O importante a ser observado aqui é que ele omitirá o diretório .a1 . Para incluí-lo, você teria que executar algo semelhante a: du --max-depth=2 mydir/{.[!.]*,*} (mas eu acho que pode haver uma maneira mais fácil e mais genérica que eu não conheço). Também não calculará o tamanho total do diretório mydir .
E sim, os tamanhos informados por du incluem os tamanhos das subpastas.