No contexto do que o ProcExp mostrará, um programa com uma pasta ou diretório aberto significa que o programa está usando arquivos dentro dessa pasta ou diretório ou está mantendo o diretório na memória para que possa usar arquivos que possam acabar nessa pasta ou diretório.
Em 99% dos casos, isso significa que existe um recurso compartilhado, uma biblioteca ou uma dll dentro de algum diretório como% programfiles% \ Common Files \ ou o diretório% windir% \ system32 e que os programas estão usando esses arquivos a fim de realizar seus propósitos.