Você pode nunca ter 100% de certeza de que removeu completamente um cavalo de tróia. Quando sua segurança é violada, você não sabe exatamente o que aconteceu.
Você parece ter entendido muito bem o que isso fez com o seu sistema. Mas e se ele instalasse um rootkit que você não encontrasse e fosse invisível para o seu software antivírus?
Há toneladas de coisas para pensar como exemplo acima. A única maneira de ser completamente certo é a reinstalação do sistema completo .
Se você não está à altura, execute alguns pacotes de software antivírus, etc., verifique todas as configurações de inicialização (registro, msconfig, etc.) procurando por processos de execução "estranhos" e elimine-os para ver o que acontece.