Nota: Esta é uma pergunta um pouco vaga. Então, só posso dar uma resposta vaga.
Desligamentos enquanto o disco rígido está funcionando podem causar muitos danos. Normalmente, é limitado aos arquivos com os quais a unidade está trabalhando no momento. O que causou o desligamento pode ser um fator também. Cada situação é diferente.
Na minha experiência, desde que os dados não tenham sido corrompidos antes do desligamento durante o Windows Update, você poderá recuperá-los. Se nenhum outro programa estava sendo executado ou arquivos abertos quando o desligamento ocorreu, a corrupção que eles estão relatando provavelmente está relacionada aos arquivos do Windows. Portanto, é provável que seus arquivos de dados pessoais sejam recuperados, mas o Windows e os programas precisarão ser reinstalados.
A porcentagem que eles estão informando é uma estimativa e pode conter seus dados pessoais, enquanto os 40% são prováveis arquivos do Windows. Não há como dar uma resposta definitiva aqui.