No bloco <VirtualHost>
para um determinado VirtualHost, você pode especificar uma entrada CustomLog
para fazer com que solicitações que vão para esse host virtual sejam enviadas para seu próprio arquivo de log. Esta pergunta sobre estouro de pilha fornece um exemplo:
<VirtualHost *:80>
ServerName example.com
DocumentRoot /var/www/domains/example.com/html
ErrorLog /var/www/domains/example.com/apache.error.log
CustomLog /var/www/domains/example.com/apache.access.log common
php_flag log_errors on
php_flag display_errors on
php_value error_reporting 30719
php_value error_log /var/www/domains/example.com/php.error.log
</VirtualHost>
Então, isso deve permitir que você divida tudo por vhost e permita que você obtenha estatísticas significativas.