Como Bruno Pereira disse, o número da versão zfs do FreeNAS precisa ser igual ou menor que o número de versão do zfs que o Ubuntu suporta. Depois do zfs v28, isso mudou para a necessidade de suporte das opções zfs ativadas.
Para o 16.04, as versões do zfs e do FreeNAS 9.10 ou mesmo do FreeNAS 10 são iguais e um conjunto FreeNAS pode ser convertido. Acabei de converter uma instalação de avaliação do FreeNAS 10 para uso em 16.04.