Não é minha resposta, mas acho que o que você precisa é a resposta aceita para WinMerge e Diffmerge
Existealgumamaneiradefiltrarestesatravésdalinhadecomandoparaqueelesnãoapareçam.Aúnicacoisaquedescobriéquevocêpodeocultarumitemumporum,masissoéimpraticávelcommuitaspastas.Nãohánadasobessesarquivos,apenasmostracomo"Pastas são diferentes".
Não é minha resposta, mas acho que o que você precisa é a resposta aceita para WinMerge e Diffmerge
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