Eu acho que o memenu está desativado, ligando-o no menu de transmissão, veja isso .
Acho que isso ajuda você.
EDITAR:
Eu tenho o pacote thunderbird-globalmenu
instalado (por um longo tempo ...)
No thunderbird você tem que mudar algumas preferências talvez
Na versão alemã, observe o seguinte:
Bearbeiten - > Einstellungen - > Allgemein - > Im Nachrichtenmenü anzeigen (verificar)
e talvez verifique "Für Nachrichten in allen Ordner"
em inglês acho que as preferências são algo como
Editar - > Preferências - > Global (Menu no lado esquerdo) - > Mostrar no Menu de Mensagens (cheque)
e talvez marque "Para todas as pastas"
Tenho o Ubuntu 12.04 instalado com o thunderbird 17.0.3 e consigo ver novas mensagens no menu e obter um ícone azul