Ebtables age apenas em quadros passando por uma interface de ponte.
Se você quiser bloquear um site com base em seu endereço MAC, faça uma ponte e adicione sua interface a ele. Em seguida, direcione o tráfego pela ponte e use ebtables para impedir o tráfego da ponte para esse endereço MAC, como tal:
ebtables -A OUTPUT -d 00: 05: 68: 02: 68: dd -j DROP
Funciona.