Então, fazendo a pesquisa sobre isso, parece que a maneira de controlar o ventilador é emitir o seguinte comando:
i8kctl fan R L
Onde R é o modo de ventilador direito e L é o modo de ventilador esquerdo. Os modos são os seguintes:
0 turn the fan off
1 set low speed
2 set high speed
- don't change the state of this fan
Você deve instalar o sensors-applet
que contém um applet que você pode adicionar ao seu painel do gnome. Isso controla a temperatura do seu processador e sistema e você certamente deve manter um controle sobre isso, se você estiver indo para mudar a velocidade do ventilador. Uma vez que você tenha o applet instalado, basta clicar com o botão direito do mouse no painel do seu gnome e clicar em Add to panel...
. Veja a lista de Hardware Sensors Applet