O Yanking é um recurso do próprio Vim que, por padrão, só funciona para esse processo. Se você quer usar a área de transferência, você deve usar "* y (seleção atual) ou" + y (área de transferência real) como descrito nas seções 04.7 e 09.3 da ajuda do Vim. Use os seguintes comandos no Vim para procurar:
:help 04.7
:help 09.3
O PuTTY, no entanto, não tem acesso a nenhuma área de transferência da máquina à qual você está se conectando.
Uma solução rápida seria usar o comando cat no arquivo, não em uma sessão de tela, e em seguida, selecione o texto em seu PuTTY que copia automaticamente. Fazer isso fora de uma sessão de tela garante que você possa rolar para cima e obter todo o texto.