Nenhum software AV é 100% eficaz, todos eles são baseados em arquivos de assinatura e um mecanismo heurístico não tão bom, se um novo malware de alta qualidade que não foi adicionado ao arquivo sig estiver lá, ele passará por qualquer AV software.
Os script kiddies não estão mais codificando malware, alguns dos melhores programadores do mundo estão agora criando malware, e são bastante proficientes em contornar a maioria dos softwares antivírus, pelo menos até serem descobertos, identificados e adicionados à lista sig - é um jogo de gato e rato e o rato ganhou no seu caso.
Sim, os scanners manuais, como o MBAM, o Super Anti Spyware, são bons para usar em cima do software antivírus ativo.