Se você tiver que selecionar se deseja executar o Windows ou o Ubuntu, o título na parte superior da tela diz "Gerenciador de inicialização do Windows" do que você provavelmente usou o Wubi e deve seguir este link .
Experimente o link acima e, se não funcionou ou você não pode ou não quer (sem tempo ou sem interesse) entender o que acontece no howto, eu reinstalaria o Ubuntu com mais espaço em disco.
PS: Não se esqueça de salvar seus dados quando você trabalha com partições!