Isso não é suportado por nenhum sistema que eu conheça.
Mas não seria tão difícil de fazer, mas seria necessário poder combinar as entradas do mixer com as janelas das quais eles parecem vir ( este requisito é a parte difícil. ) e, em seguida, procurar a localização da janela para uma entrada e modificar o equilíbrio do mixer para essa entrada em conformidade.
Usando a notificação de alteração de estado do X11, seria possível atualizar o saldo de uma entrada em tempo real sem pesquisar as localizações da janela.