Não tenho certeza se as outras respostas têm alguma experiência com o Suitcase Fusion, mas uso esse software há anos, e aprendi no começo do jogo que:
Se você gerencia suas fontes usando o Suitcase Fusion, ele armazena as fontes em seu próprio diretório secreto e apenas as adiciona às fontes do Windows quando você ACTIVA essas fontes.
Agora, depois de ter desinstalado o Suitcase Fusion, suas fontes (como você disse, ocultas) não podem ser encontradas nas fontes do Windows e nunca estiveram lá para começar.
Eu não usei o Windows Suitcase Fusion por um bom tempo agora (tendo mudado para um Mac para trabalho de design), e se bem me lembro, as fontes que você gerenciou com o Suitcase Fusion podem ser encontradas em C: \ Documents And Settings [ nome de usuário] \ Application Data \ Extensis \ Suitcase ... algo algo.