mkfs não cria uma partição, cria um sistema de arquivos. Você criou um sistema de arquivos em todo o dispositivo /dev/sdd (em oposição a uma partição, por exemplo, /dev/sdd1 ).
Seu disco não é particionado, o layout resultante é chamado de superfloppy. Se você quiser utilizar (quase) todo o dispositivo em um único sistema de arquivos, então é melhor ter uma tabela de partição com uma partição. Compare: Usos da configuração de disco de partição única .
Ferramentas como fdisk ou gdisk devem permitir que você crie uma tabela de partições sem nenhuma preparação (você perderá dados do sistema de arquivos atual, então copie o que você deseja salvar). Se você criar uma única partição, execute posteriormente mkfs.ext4 com /dev/sdd1 como destino para criar um sistema de arquivos na partição.
Se você quiser limpar o sistema de arquivos atual (antes de fdisk / gdisk / whatever ou por qualquer outro motivo), então
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preenche o inicio do disco com zeros, 1MB deve ser o suficiente:
dd if=/dev/zero of=/dev/sdd bs=1M count=1 -
ou use
wipefsem/dev/sdd; esta ferramenta é projetada para apagar arquivos.