Sim, você pode fazer isso (seus arquivos O.S. serão carregados na memória do sistema, o USB é usado apenas para ler esses arquivos no momento da inicialização, depois disso você pode usar o seu pendrive da maneira que quiser ....). No entanto, eu recomendo que você crie uma segunda partição (estendida) em sua unidade flash USB inicializável. Desta forma você pode "isolar" o O.S. de outros arquivos.
De acordo com este site , você pode usar os seguintes particionadores para estender sua partição no Linux:
- Diskdrake ( The default Mandrake tool, by far superior and easy to use even for people that never came close to a partition before )
- fdisk ( commandline tool for the more advanced, but still very intuitive )
- Diskdruid ( The RedHat partition tool )
- QTParted ( GNU clone of Partition Magic, the tools from SUSE, RedHat and PCLos are based on this )
- Yast ( the SUSE partition tool )
- Qparted ( the non-GUI brother of QTParted, I would go for fdisk myself )