Você pode modificar muitas das configurações do terminal em seu arquivo ~ / .Xdefaults. Esta postagem nos fóruns do gentoo (que irá trabalhar a distribuição cruzada a propósito) dá muitos ajustes sobre como definir esta informação. Muitos deles são para o urxvt, mas devem ser fáceis de ajustar para o XTerm ou até mesmo para o gnome-terminal, a menos que você queira instalar o urxvt (que eu pessoalmente prefiro).
Para o console principal fora do X, o programa setterm pode ser usado para configurar muitas informações da tela. Não tenho certeza de como isso funcionará em terminais virtuais (xterm, etc.), mas ele tem configurações de cor de primeiro plano, plano de fundo etc. que você pode ajustar. Ele pode ser chamado de /etc/rc.d/rc.M em sua máquina, ou você pode simplesmente criar um arquivo de script para as informações de setterm para as vezes que você usá-lo. Para informações detalhadas sobre o setterm, não há lugar melhor que man setterm para encontrá-lo.