Há duas coisas que eu sugiro tentar, o que pode explicar a diferença:
- Primeiro, tente alterar o Filezilla do modo PASV / PASSIVE para o modo ACTIVE.
- Se isso não funcionar, tente conectar sem criptografia no Filezilla (o FTP não criptografado pode ser o que o Windows Explorer está usando, mas o Filezilla parece estar usando a criptografia TLS). Eu recomendo usar criptografia para FTP, mas estou listando o que pode ser uma diferença.