Dê uma olhada no seu drive externo, via terminal:
Last login: Tue Sep 22 07:42:31 on console
cd dhcp105-37:~ Ben$ cd /Volumes/External_Drive
dhcp105-37:External_Drive Ben$ ls -la
total 954440
drwxrwxr-x@ 29 Ben staff 1054 Aug 18 15:43 .
drwxrwxrwt@ 6 root admin 204 Sep 22 07:43 ..
-r-------- 1 root staff 16 Aug 5 2008 .001ff3584d0c
-rw-rw-r--@ 1 Ben staff 21508 Sep 16 14:56 .DS_Store
drwx------ 3 Ben staff 102 Aug 5 2008 .Spotlight-V100
drwxrwxrwt@ 3 Ben staff 102 Oct 1 2008 .TemporaryItems
d-wx-wx-wt 3 Ben staff 102 Sep 11 13:39 .Trashes
-rw-r--r--@ 1 Ben staff 227377 Apr 9 15:36 .VolumeIcon.icns
-rw-r--r-- 1 Ben staff 0 Aug 5 2008 .com.apple.timemachine.supported
drwx------ 88 Ben staff 2992 Sep 22 07:49 .fseventsd
drw
Por favor, note o .Trashes que existe no disco externo. Dê uma olhada no seu externo e veja se a pasta está lá. Se assim for, então um comando rf dessa pasta deve funcionar.
As pastas de backup do Time Machine são de fato diferentes, mas, no meu entender, elas podem ser excluídas como qualquer outra pasta / arquivo. A questão é que, como os backups do Time Machine são arquivos com link físico, quando você o exclui de um conjunto de backup, talvez você o exclua de vários conjuntos ao mesmo tempo.