Remover o IE é uma tarefa bastante simples, impedindo que ele seja instalado novamente, o que é uma questão totalmente diferente, todos exigindo que você desabilite a capacidade de instalar programas completamente. Você também terá que tomar cuidado com o Windows Updates tentando automaticamente instalar o IE em sua máquina novamente.
O que você pode querer fazer é usar um aplicativo (NetLimiter - Bloquear aplicativos, portas do uso da Internet) / firewall (bloquear aplicativos e portas, da Internet / rede) / proxy (bloquear URLs específicos) para determinar quais aplicativos para usar a internet, quais portas são permitidas, quais sites são permitidos.
O mais eficaz seria um proxy hospedado em uma máquina separada, uma pequena caixa linux seria suficiente, configurando quais URLs são acessíveis, alguns programas proxy podem permitir que você limite a duração (mais precisamente, apenas permitir que usuários acessem sites entre determinados intervalos de tempo ou não a todos), bem como a largura de banda, sendo inteligentes o suficiente para saber quando os dados são específicos da rede ou específicos da Internet