Meu palpite é que quebrou uma conexão de dados do USB para a placa interna.
Ele não deve causar nenhum dano ao seu laptop, a menos que ele tenha causado curto-circuito em algo elétrico que faria com que um surto retornasse através do USB para o seu laptop. Meu palpite é que isso não aconteceu, eu esperaria que uma sobrecarga faria com que a placa-mãe desligasse imediatamente seu laptop.
Você pode tentar abrir o protetor plástico do pen drive e inspecionar pontos de solda quebrados. Não seria tão difícil tentar resgatá-lo se houvesse um quebrado, provavelmente apenas teria que derreter a solda o suficiente para "pular" de volta.