A conta SYSTEM
tem SeRestorePrivilege
, que concede a ele o direito de gravar nos dados ou ACL de qualquer objeto que possa ser protegido. (Mais ou menos como administradores elevados podem passar por ACLs usando a guia Segurança das Propriedades do objeto.) Esses poderes também podem ser usados pelo SYSTEM
nas atualizações da Diretiva de Grupo.
Como um complemento, a atualização responsável por sua dor é, na verdade, KB3035583 . Você pode tentar identificar qual atualização é responsável por um determinado arquivo pesquisando o Google por site:support.microsoft.com
seguido pelo nome do arquivo, já que os artigos da atualização de KB sempre têm tabelas de arquivos atualizados.