A mensagem de erro é bem clara. Você deve remover
<Directory> and </Directory>
do seu arquivo .htaccess. .htaccess é aplicado automaticamente para o diretório em que você o coloca, portanto, NÃO DEVE ser necessário referenciar <Directory> diretivas em .htaccess . Além disso, a documentação do apache menciona claramente que <Directory> diretivas têm escopo de configuração do servidor e host virtual ( link - o que significa que você só pode colocá-los em httpd.conf (ou seja, main config) e dentro das diretivas <VirtualHost>