O motivo foi o armazenamento em cache do SRT.
Liguei para acelerar minha partição Win para jogos, e como meu SSD de armazenamento em cache tinha 64 GB (tamanho máximo atual para SRT), basicamente armazenava em cache tudo o que tinha em mãos desde que não tinha acabado espaço ainda para começar a purgar. Como tal, tudo o que o Windows pôde ver foi o conteúdo em cache, retirado do SSD, enquanto o Ubuntu (já que não há suporte SRT para ele) viu o estado atualizado.
Depois que eu desativei o SRT e reinicializei para limpar o cache manualmente, eles se comunicam com a partição sem falhas. Naturalmente, isso é inaceitável porque preciso do meu SRT no sistema operacional Win, portanto, basta conectar uma nova unidade para servir como o disco de compartilhamento. Dessa forma eu tenho alguma redundância também.
Obrigado pela ajuda a todos!
Editar: conforme solicitado, algumas informações sobre SRT: link Basicamente, é um mecanismo de cache que usa um SSD de nível de entrada para saber quais arquivos você usa mais e, em seguida, usa o SSD para carregá-los em vez de carregá-los do disco rígido. Isso é suportado apenas no Windows por enquanto, e fornece desempenho SSD com HDDs grandes - capacidades enormes na velocidade do SSD para a grande maioria dos seus arquivos usados regularmente
Por exemplo, meu tempo de inicialização do Windows passou de 24 segundos para 15 segundos, enquanto o carregamento de um nível maior no Skyrim no máximo de detalhes leva cerca de 1 a 2 segundos. Não tenho certeza de como essas comparações são úteis para a base de usuários do Superusuário, mas aqui estão elas:)
Você pode ler mais sobre isso apenas pesquisando o Intel SRT - há muitas análises e referências por aí.