É o chipset da Intel que está fazendo isso, e isso nunca mudará, pois é uma limitação de hardware / chipset.
Quando você instala uma placa PCIe 4x ou superior no slot x16, ela desliga o DVI e deixa a porta VGA analógica ativada. Se você instalar uma placa PCIe sem vídeo 1x, as duas portas de vídeo permanecerão ativas.
Se for uma placa de vídeo, independentemente da quantidade de canal PCIe (1x, 4x, etc.), ambas as portas de vídeo on-board serão desativadas.
Eu acabei de passar por toda essa diversão em um DQ45CB (os mesmos gráficos on-board da série G41) tentando fazer um terceiro monitor funcionar. :)
Documento de especificações da Intel DQ45CB na verdade tem uma boa tabela:
Não é a resposta que você esperava, tenho certeza, mas é assim que ela vai. ;)