Se a codificação do buffer não for especificada, o EMACS tentará determinar automaticamente. Isso causa um problema se o buffer contiver um caractere UTF-8 ou Latin1 e o subprocesso estiver determinado a enviar o ASCII.
Eu resolvi o problema colocando esta linha como a primeira linha dos meus arquivos .tex
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% -*-mode: LaTeX; coding: us-ascii;-*-