Eu encontrei uma maneira de usar o ZENcast Organizer. Eu mudei a configuração para que os episódios de uploadad não sejam convertidos em Zencast - o gênero é definido como "podcast", por isso só posso ouvir os podcasts por gênero.
Não há possibilidade de excluir episódios já ouvidos, mas posso definir um limite para que apenas os episódios mais recentes permaneçam em um dispositivo. Não é tão bom quanto eu desejo, mas está perto o suficiente.