Sim, funcionará bem.
Como você disse, basta desligar o Wi-Fi interno, o pendrive pode encontrar os drivers certos do Windows Update, caso contrário, instalar os drivers fornecidos pelo fabricante.
Eu tenho um laptop Asus de 1 ano de idade (modelo UX31) rodando o Windows 7, que tem um problema freqüente com o wifi que eu nunca cheguei ao fim ( link ).
Se eu desligar o WiFi embutido e instalar um Wi-Fi USB, isso funcionará?
Eu só estou querendo saber se eu desligar o Wi-Fi embutido isso significa que qualquer conexão de rede WiFi está desativada no Windows, ou apenas esse cartão em particular?