Eu uso uma etapa extra onde primeiro encontro números precedidos por parágrafos e substituo somente a formatação pelo realce. Certifique-se de ter selecionado uma cor para o marcador antes de executar a pesquisa (ou seja, a cor de destaque não está definida como Sem cor).
Então eu faço a minha busca e substituo para aplicar o estilo Título e nenhum destaque para a sequência numérica (isto é, ignore o ^ 13 neste achado) que estão destacados (como eu sei que todos esses são os números de título, todos os outros números no doc não estão destacados).
Em seguida, um último achado e substituição para encontrar todos os ^ 13 que estão destacados e substituem pelo formato não destacado.