Este parece ser um bug conhecido:
A lente de código Clion 2016.1.1 no Linux mostra ilegível texto de fonte em negrito .
In Clion 2016.1.1, the lens mode on Linux (opensuse leap 42.1) looks bad. It shows bold text which is aliased and unreadable. This problem is the same across themes and font settings. See attached file.
The lens mode used to work just fine in Clion 1.2.4 with proper anti-aliasing in place.
A única solução alternativa é definir as configurações do antialiasing para o editor em escala de cinza a partir de subpixel. Embora seja comentou que quando a nova caixa de texto de passar o mouse aparece, será alias por uma fração de segundo e, em seguida, renderizado corretamente. Ou você sempre pode voltar para a versão anterior.
O problema parece estar sob consideração, embora a correção de bug proposta foi ineficaz.