/usr/bin/java
é geralmente apenas um link simbólico, às vezes para a sua instalação real do java, às vezes para algo como /etc/alternatives/java
.
Qual java você está usando? Sol / Oráculo OpenJDK? E qual é a sua distro?
Executando o comando:
find / -type f -name java
Você deve começar a encontrar o binário java real.