Isso parece ser um problema com o XMPP em geral. Veja por exemplo aqui ou aqui . Há sugestões de que isso pode ocorrer porque você definiu a desativação de todos os aplicativos nas suas configurações de privacidade do Facebook.
Estou usando um cliente XMPP para me conectar ao facebook (Mensagens da Apple) e descubro que nem todas as mensagens chegam ao meu cliente. Muitos se perdem no caminho.
Eu sou o único com essa experiência? Existe uma maneira de melhorar? Quem é o culpado?