A única menção de "virtual" no EULA é esta seção:
d. Use with Virtualization Technologies. Instead of using the software directly on the licensed computer, you may install and use the software within only one virtual (or otherwise emulated) hardware system on the licensed computer. When used in a virtualized environment, content protected by digital rights management technology, BitLocker or any full volume disk drive encryption technology may not be as secure as protected content not in a virtualized environment. You should comply with all domestic and international laws that apply to such protected content.
Para mim, isso significa que, enquanto você estiver executando apenas uma instância da máquina virtual (não inicie o VMware Fusion duas vezes ou algo parecido), poderá alternar entre sua licença para usar o software no VMware Fusion pelo EULA acima) e sua licença para usar o software em uma máquina física quantas vezes quiser (já que é a mesma cópia licenciada pela qual você pagou).
Se você ficar preso, você pode enviar um email para [email protected] e ver o que eles dizem. Observe que, quando entrei em contato com o suporte de licenciamento deles no passado, eles não tinham muita clareza sobre a virtualização, exceto para dizer que é altamente recomendável que você use o Hyper-V em vez do VMware.