Descobri como redefinir (todas) as modificações graças a isso: link Resumindo: 'setxkbmap -layout us' corrigiu.
Encontrei uma solução melhor do que xmodmap: xdotool ( link )
Para configurar as teclas ijkl como teclas de seta com o modificador alt como você tem que ir para configurações > teclado > atalhos > atalhos personalizados
Quando você estiver lá, clique no botão "+".
Dê um nome a ele e digite este comando: xdotool keyup Alt && xdotool key Up && xdotool keydown Alt
depois disso você tem que atribuir o atalho. Para fazer isso, clique em "Desativar" no lado direito e pressione os botões de atalho.
Executa 3 comandos. O primeiro define o estado da tecla Alt para 'up' (não pressionado). O segundo percebe um pressionamento de tecla (no exemplo) da tecla Para cima. O terceiro define o estado da tecla Alt de volta para 'down' (pressionado).
Se você quiser usar Ctrl + [tecla de seta], precisará criar outro atalho com Ctrl + Alt + [letra]. O comando que ele executa precisa ser o MESMO sem a tecla Ctrl. Isso ocorre porque o atalho Ctrl-Alt- [letra] é outro atalho que Alt + [letra], mas uma vez que 'tecla xdotool [tecla de seta]' é executada, a tecla Ctrl já está inativa, então ele será exibido como se você tivesse pressionado Ctrl + [tecla de seta]
Também facilita a navegação quando você pressiona a tecla Ctrl se ignorar a entrada Ctrl nas teclas Para cima e Para baixo. Para fazer isso, usei o comando: xdotool keyup Alt && xdotool keyup Ctrl && xdotool key Up && xdotool keydown Ctrl && xdotool keydown Alt