Eu tenho um atalho de teclado para iniciar um script para começar o conky para mim.
Agora parece que você tentou "as coisas certas". Na seção de comando dos atalhos de teclado, tenho: /home/karl/bin/start-conky.sh
Se você tiver cd ~/Downloads && ./bash-script.sh
nesse campo, você tentou alterá-lo para: /home/username/Downloads/bash-script.sh
?