Dado que o gpg irá apenas criptografar um único arquivo (ou equivalente), a solução natural é criar um tarball criptografado com gpg.
Primeiro, deixe-me mostrar a abordagem em duas etapas.
$ tar -C /home/user -cf scripts.tar labs-scripts/
$ gpg -r 0xabcdef -e scripts.tar
Você também pode fazer isso em uma varredura, canalizando o vapor de alcatrão.
$ tar -C /home/user -cf - labs-scripts/ | gpg -r 0xabcdef -o scripts.tar.gpg -e