Isso parece normal para mim. Olhando para esta questão , aparece a causa da mensagem de erro que você está vendo é a falta de uma cadeia de operação ilegal na saída de ssh -G . No entanto, o mesmo acontece no meu sistema, que tenho 99,9% de certeza de que está limpo no momento.
Quanto à saída de aviso no rkhunter, dê uma olhada em esta pergunta sobre o ServerFault - isso também parece normal.
No entanto, se você concluir que sua máquina está infectada, a maneira mais segura de remover qualquer malware é limpar e reinstalar o sistema.