Eu tenho usado o Windows e o Linux há muitos anos. Embora eu adore ter dois sistemas, um para windows e um para linux, isso geralmente não é possível para as pessoas. Em sistemas que eu preciso ter janelas em como meu PC de jogos eu uso VMWare ou Sun VirtualBox para executar uma máquina virtual Linux.
Eu mantenho o sistema host nessas máquinas como janelas para que eu esteja sempre pronto para iniciar meus aplicativos somente para jogos / janelas.
Esta pode ser uma boa solução, é rápida e fácil, permitindo-lhe iniciar o Linux como qualquer outra aplicação no seu sistema sem precisar de uma reinicialização.