O que você precisa é de Enumeração Baseada no Acesso . ABE é um método de mostrar apenas a um usuário as pastas às quais ele tem direitos de acesso. Se o usuário não tiver permissão, ele nem sabe que existe.
Este link fala sobre a configuração do ABE - mas essencialmente, é um caso de abrir o gerenciador do servidor, carregar "Serviços de arquivo e armazenamento", selecionar as propriedades de um compartilhamento e ativar o ABE dentro do menu de propriedades do compartilhamento.