Não há necessidade de fazer isso. O kernel do Ubuntu é um conjunto fixo de módulos e todos os módulos (que ainda não estão compilados no kernel) são carregados conforme necessário.
Se suas portas USB não estão funcionando, então há outro problema com elas, e não com o Ubuntu não as encontrar.
Se a porta estiver instalada corretamente, use o comando dmesg
para ver as mensagens mais recentes do sistema ... conecte um dispositivo USB e verifique a saída (ou poste aqui ou em um pastebin) de dmesg | tail
para quaisquer pistas do que está errado. Se não houver mensagens lá em relação ao USB, provavelmente as portas provavelmente não serão instaladas.