O problema que você descreveu é um problema conhecido desde o Karmic e também ocorre no Lucid.
A solução é iniciar o vmware, mas também forçar o VMWare a usar o mouse GTK, ou seja,
export VMWARE_USE_SHIPPED_GTK=yes && vmware
Como alternativa, você pode editar /etc/vmware/bootstrap
para colocar a variável de ambiente exportada acima antes de invocar o vmware.