Além de ser inconveniente, suponho, e normalmente você não pode ter mais de um carregador de inicialização em uma unidade. Você escolhe uma unidade de inicialização e não uma partição.
Então, em um sistema de partição dupla disco único ? Simplesmente não funcionaria. Você teria que usar o bootloader na unidade e escolher um sistema operacional a partir daí.
Em uma configuração multidisk com um sistema operacional por drive, ele funciona muito bem - atualmente dualboot linux (que pega janelas de qualquer maneira) e windows (que não tem a menor idéia de compartilhar um chassi com linux) e usar o menu de inicialização uefi Escolha o que iniciar. Em seguida, ele carrega o setor de inicialização dessa unidade e você está pronto para ir.