Meu palpite é que o mais fácil é:
Obtenha o compartilhamento de arquivos do Windows funcionando.
Verifique se você tem o programa smbclient em sua caixa Linux. Isso geralmente está em um pacote chamado samba-client ou similar.
Crie um script, algo como smbclient //1.2.3.4/Share -c 'get /file /dest/dir1'
Dependendo de quais são suas permissões, você pode adicionar um arquivo de autenticação, nome e senha. então seria smbclient -a smb_auth.txt //1.2.3.4/Share -c 'get /file /dest/dir1'
Agende isso no cron.