Resolvido aqui . Tem alguns problemas sérios de permissão e precisa fazer uma instalação limpa.
Editar: citação
Essa listagem de seu diretório / usr gera todos os tipos de alerta com os valores "2000 513" para proprietário e grupo. A aparência dos números em vez de nomes de usuários / grupos indica que o usuário e o grupo não existem em seu sistema. Além disso, "2000" é um id de usuário muito improvável para qualquer sabor do Ubuntu. UIDs e GIDs sem sistema iniciam a partir de 1000 e sobem um de cada vez; para chegar a 2000 você teria que ter adicionado mil usuários adicionais! Da mesma forma, a numeração de UID / GID do sistema começa em 0 (que é "root") e raramente chega a 200.
O seu sistema tem outros usuários? Se sim, é provável que um deles possa ter feito coisas incomuns sem o seu conhecimento?
Quando qualquer um dos meus sistemas mostra tais acontecimentos improváveis, meu primeiro pensamento é fazer o backup de todos os dados críticos, depois desarmar a caixa e reinstalar tudo do zero. Enquanto todos os sabores do Linux são muito menos vulneráveis do que alguns sistemas mais amplamente utilizados, o prejuízo é sempre uma possibilidade - e os gremlins podem causar corrupção de arquivos sem qualquer dano humano envolvido. Você descreve o sistema como "valioso", de modo que um bom backup precisa estar disponível a qualquer momento, antes de fazer qualquer tentativa de consertar as coisas.